MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 41182

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017846	T	6	6	67	72	0 %	100 %	0 %	0 %	387119834
2	NC_017846	TTC	2	6	95	100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387119834
3	NC_017846	GTC	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119834
4	NC_017846	CAG	2	6	116	121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119834
5	NC_017846	AGG	2	6	153	158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387119834
6	NC_017846	GTC	2	6	182	187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119834
7	NC_017846	GGC	2	6	257	262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387119834
8	NC_017846	TGC	2	6	326	331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119834
9	NC_017846	CTTGG	2	10	371	380	0 %	40 %	40 %	20 %	387119834
10	NC_017846	GTT	2	6	391	396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387119834
11	NC_017846	CGG	2	6	419	424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387119834
12	NC_017846	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	387119834
13	NC_017846	GGC	2	6	594	599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387119834
14	NC_017846	GAT	2	6	627	632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387119834
15	NC_017846	ATG	2	6	799	804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387119834
16	NC_017846	CCG	2	6	877	882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387119834
17	NC_017846	GGT	3	9	888	896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387119834
18	NC_017846	CGTT	2	8	913	920	0 %	50 %	25 %	25 %	387119834
19	NC_017846	TCC	2	6	960	965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387119834
20	NC_017846	T	7	7	980	986	0 %	100 %	0 %	0 %	387119834
21	NC_017846	GTT	2	6	1007	1012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387119834
22	NC_017846	ATTTT	2	10	1033	1042	20 %	80 %	0 %	0 %	387119834
23	NC_017846	TG	3	6	1484	1489	0 %	50 %	50 %	0 %	387119835
24	NC_017846	ATT	2	6	1504	1509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119835
25	NC_017846	TCG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119835
26	NC_017846	ACC	2	6	1710	1715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387119835
27	NC_017846	TTA	2	6	1728	1733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119835
28	NC_017846	TGA	2	6	1838	1843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387119835
29	NC_017846	A	6	6	1885	1890	100 %	0 %	0 %	0 %	387119835
30	NC_017846	TGA	2	6	1909	1914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387119835
31	NC_017846	TTC	2	6	2019	2024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387119835
32	NC_017846	CAT	2	6	2031	2036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387119835
33	NC_017846	AGC	2	6	2287	2292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119835
34	NC_017846	T	6	6	2314	2319	0 %	100 %	0 %	0 %	387119835
35	NC_017846	CAT	2	6	2343	2348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387119835
36	NC_017846	CGG	2	6	2396	2401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387119835
37	NC_017846	TGG	2	6	2501	2506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387119836
38	NC_017846	CCGT	2	8	2528	2535	0 %	25 %	25 %	50 %	387119836
39	NC_017846	CCGC	2	8	2627	2634	0 %	0 %	25 %	75 %	387119836
40	NC_017846	GGC	2	6	2649	2654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387119836
41	NC_017846	GCG	2	6	2809	2814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387119836
42	NC_017846	GCC	2	6	2821	2826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387119836
43	NC_017846	GGA	2	6	2928	2933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387119836
44	NC_017846	AAT	2	6	2936	2941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387119836
45	NC_017846	T	6	6	2955	2960	0 %	100 %	0 %	0 %	387119837
46	NC_017846	AGA	2	6	3023	3028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119837
47	NC_017846	ATT	2	6	3089	3094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119837
48	NC_017846	CTG	2	6	3114	3119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119837
49	NC_017846	CCG	2	6	3120	3125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387119837
50	NC_017846	CCG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387119837
51	NC_017846	AGC	2	6	3214	3219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119838
52	NC_017846	CAG	2	6	3326	3331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119838
53	NC_017846	CAA	2	6	3387	3392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387119838
54	NC_017846	AGA	2	6	3415	3420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119838
55	NC_017846	ATT	2	6	3426	3431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119838
56	NC_017846	ATT	2	6	3443	3448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119838
57	NC_017846	TGG	2	6	3472	3477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387119838
58	NC_017846	GTG	2	6	3496	3501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387119838
59	NC_017846	ATT	2	6	3532	3537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119838
60	NC_017846	CAAA	2	8	3884	3891	75 %	0 %	0 %	25 %	387119839
61	NC_017846	CCA	2	6	3906	3911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387119839
62	NC_017846	AGCA	2	8	3968	3975	50 %	0 %	25 %	25 %	387119839
63	NC_017846	AGA	2	6	3981	3986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119839
64	NC_017846	ATT	2	6	4060	4065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119839
65	NC_017846	CCG	2	6	4096	4101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387119839
66	NC_017846	GC	3	6	4123	4128	0 %	0 %	50 %	50 %	387119839
67	NC_017846	TTA	2	6	4141	4146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119839
68	NC_017846	GC	3	6	4215	4220	0 %	0 %	50 %	50 %	387119839
69	NC_017846	AGA	2	6	4242	4247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119839
70	NC_017846	TGA	2	6	4296	4301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387119839
71	NC_017846	GTT	2	6	4332	4337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387119839
72	NC_017846	GCA	2	6	4379	4384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119839
73	NC_017846	GATG	2	8	4467	4474	25 %	25 %	50 %	0 %	387119839
74	NC_017846	ATA	2	6	4479	4484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387119839
75	NC_017846	TATT	2	8	4524	4531	25 %	75 %	0 %	0 %	387119840
76	NC_017846	TTA	2	6	4538	4543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119840
77	NC_017846	GTG	2	6	4720	4725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387119840
78	NC_017846	GAA	2	6	4839	4844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119840
79	NC_017846	ACC	2	6	4911	4916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387119840
80	NC_017846	A	6	6	4920	4925	100 %	0 %	0 %	0 %	387119840
81	NC_017846	AAT	2	6	4951	4956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387119840
82	NC_017846	ATCAC	2	10	5155	5164	40 %	20 %	0 %	40 %	387119841
83	NC_017846	ACG	2	6	5244	5249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119841
84	NC_017846	ACC	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387119841
85	NC_017846	AAT	2	6	5267	5272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387119841
86	NC_017846	TTC	2	6	5325	5330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387119841
87	NC_017846	CCG	2	6	5341	5346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387119841
88	NC_017846	CGT	2	6	5399	5404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119841
89	NC_017846	CAC	2	6	5451	5456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387119841
90	NC_017846	TCT	2	6	5476	5481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387119841
91	NC_017846	GGA	2	6	5502	5507	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387119841
92	NC_017846	ATC	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387119841
93	NC_017846	ATC	2	6	5770	5775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387119841
94	NC_017846	GAA	2	6	5913	5918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119841
95	NC_017846	GAA	2	6	6063	6068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119841
96	NC_017846	ATA	2	6	6118	6123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387119841
97	NC_017846	GCC	2	6	6181	6186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387119841
98	NC_017846	TCT	2	6	6205	6210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387119841
99	NC_017846	AAC	2	6	6302	6307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387119841
100	NC_017846	CCG	2	6	6308	6313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387119841
101	NC_017846	ATT	2	6	6351	6356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119841
102	NC_017846	GCA	2	6	6488	6493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387119841
103	NC_017846	AT	3	6	6520	6525	50 %	50 %	0 %	0 %	387119841
104	NC_017846	T	6	6	6601	6606	0 %	100 %	0 %	0 %	387119842
105	NC_017846	AAT	2	6	6671	6676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387119842
106	NC_017846	A	6	6	6886	6891	100 %	0 %	0 %	0 %	387119843
107	NC_017846	TG	3	6	6934	6939	0 %	50 %	50 %	0 %	387119843
108	NC_017846	GGA	2	6	6980	6985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387119843
109	NC_017846	ATT	2	6	6996	7001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119843
110	NC_017846	ATT	2	6	7023	7028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119843
111	NC_017846	GAT	2	6	7056	7061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387119843
112	NC_017846	CACT	2	8	7119	7126	25 %	25 %	0 %	50 %	387119843
113	NC_017846	GCCC	2	8	7128	7135	0 %	0 %	25 %	75 %	387119843
114	NC_017846	TGA	2	6	7328	7333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387119843
115	NC_017846	ACA	2	6	7508	7513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387119843
116	NC_017846	CAA	2	6	7577	7582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387119843
117	NC_017846	TG	3	6	7603	7608	0 %	50 %	50 %	0 %	387119843
118	NC_017846	ATT	2	6	7644	7649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387119843
119	NC_017846	T	6	6	7699	7704	0 %	100 %	0 %	0 %	387119843
120	NC_017846	CG	3	6	7706	7711	0 %	0 %	50 %	50 %	387119843
121	NC_017846	TGC	2	6	7735	7740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119843
122	NC_017846	TCG	2	6	7852	7857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119843
123	NC_017846	AT	3	6	7881	7886	50 %	50 %	0 %	0 %	387119843
124	NC_017846	AAG	2	6	7918	7923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119843
125	NC_017846	CAT	2	6	7928	7933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387119843
126	NC_017846	AGT	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387119844
127	NC_017846	T	7	7	8028	8034	0 %	100 %	0 %	0 %	387119844
128	NC_017846	TGT	2	6	8067	8072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387119844
129	NC_017846	CG	3	6	8077	8082	0 %	0 %	50 %	50 %	387119844
130	NC_017846	GTC	2	6	8116	8121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387119844
131	NC_017846	AAG	2	6	8147	8152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387119844
132	NC_017846	AAGA	2	8	8200	8207	75 %	0 %	25 %	0 %	387119844
133	NC_017846	TAA	2	6	8228	8233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387119844
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135	NC_017846	TAA	2	6	8331	8336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387119844
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